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1886-1888年德国科学家赫尔里格尔（H.Hellriegal）在砂培条件下证明，豆科植物只有形成根瘤菌才能固定大气中的氮。1888年荷兰学者贝叶林克（M.W.Beijerinck）分离了根瘤菌，这是微生物肥料方面的突破。现已明确那是根瘤菌的作用。这些菌的发现，促使了一家美国公司纳特尔公司于1898年生产和销售了土壤菌接种剂。自此以后，就有诸多的菌制剂用于土壤和农作物种子的拌种和包衣。

生物有机肥穴施更重要，特别是茄果类蔬菜，重茬现象不可避免。即使补施了一些生物肥、微肥，由于受温度、湿度、透气性、有机质等条件的影响，再加上幼苗根弱的原因，很难快速发挥作用，如果穴施生物有机肥，一方面可快速促进活跃土壤，提高土壤透气性，促进根系快速生长发育;另一方面可缓解因有机肥不腐熟、化肥没分解形成养分的空缺，及时供给根系养分，给根系一个良好的生长环境，促进团根早形成。

建议选择粪便或饼肥原料的中档价位的有机肥，其***较高。经过高温发酵腐熟的肥料无恶臭、手感轻、柔软有弹性，存放一段时间后可以看到些菌丝。有机肥主要为土壤提供有机质，改善土壤的固、液、气相的物理性质，保水保温。直接或间接增加有益微生物群从而加速分解有机质为作物提供养分。络合化肥中的养分提高化肥的利用率。